Прошло пять лет после победы над Галаксией. Все битвы остались в прошлом и девочки, попрятав жезлы по дальним ящикам, живут спокойной жизнью. Ами проходит практику в больнице. Рей стала настоятельницей Храма. Макото работает шеф-поваром в элитном кафе. Минако удалось стать актрисой и теперь она пропадает на съемках. Харука участвует в гонках, Мичиру открывает свои галереи и играет на концертах, но девушки находят время друг для друга. Сетцуна открыла свою дизайнерскую студию, а Хотару живет с ней и учится в медицинском институте. Все живут счастливо, хотя подруги видятся уже намного реже. А что же на счет Усаги? Она живет с Мамору, стараясь приносить пользу хотя бы дома. Тем более, что через неделю у них с Мамо-чаном должна была состояться свадьба.
Но в это время на Землю возвращаются старсы вместе со своей Принцессой. Все рады их видеть, но беспокоятся, что с их планетой что-то случилось. К счастью, по словам звездных воинов, они прилетели просто в гости, так удачно попав к свадьбе будущих Королевы и Короля. Больше всех тому, что они успели до свадьбы, радовался Сейя. До того, как состоялась свадьба, он признался Усаги в том, что любит ее до сих пор, а девушка, в тайне боящаяся семейной жизни и всегда симпатизирующая Воителю, не отказала ему сразу. Тогда он воспользовался моментом и поцеловал Цукино, но это увидел Мамору и, не зная как реагировать, предложил отложить свадьбу на неопределенный срок.
Все стало еще сложнее, когда на следующий день из будущего прилетела Чибиуса вместе с Гелиосом. Оказалось, что в Хрустальном Токио неожиданно остановилось время для всей Земли, кроме Чибиусы, Хранителя Элизиона и сейлоров. Испугавшись, что в прошлом появился новый враг, Принцесса, ее жених и их защитники отправились к вратам времени и там встретили незнакомую им девушку, которая представилась как Сейрити или Чибисейя. Оказалось, что после случившегося в прошлом появилась вторая реальность, в которой мужем Усаги стал Сейя, и в обеих этих реальностях время замерло до тех пор, пока будущая Королева Серенити не выйдет замуж за одного из парней.
Хотя девочки считали, что это ложная тревога, на самом деле враг и вправду был, но на Земле еще никто, кроме старсов, о нем не знал. Старсы прилетели, потому что могучий враг появился над Кинмоку и потребовал Рубиновый Кристалл Принцессы и, чтобы спасти планету от разрушения, они сбежали на Землю, отвлекая врага и надеясь победить его с помощью Сейлор Мун, но зная, что поступили нехорошо, не решились признаться сразу.

Новый враг был намного сильнее предыдущих. Пять Теней путешествовали по Космосу, чтобы собрать вместе пять кристаллов – Серебряный (тот, что у Сейлор Мун), Золотой (кристалл Земли, хранящийся у Гелиоса), Рубиновый (принадлежит Оливии), Сапфировый (бывший Темный Кристалл, без Мудреца он стал светлее и теперь питал Немезис) и Изумрудный (принадлежащей Принцессе созвездия Орион)
Четыре Тени первым делом напали на созвездие Орион. Принцесса Нерейд  использовала всю силу Изумрудного Кристалла, чтобы отразить их атаку от планеты и вместе с четырьмя своими защитниками сбежали как можно дальше. Попав на Землю они сразу поняли, что здесь есть сейлор воины, и девушки решили отобрать их силу, чтобы восстановить свой кристалл и самим стать сильнее.
Почему Теней было четыре, хотя должно быть пять? Очень просто. Пятая Тень – Металлия. Он был истощен, но вовсе не убит, ведь Сейлор Мун убила только Берилл. И теперь, накопив силы и почувствовав приближение остальных Теней, Металлия вновь восстановился, воскресив своих слуг, лордов, убитых сейлор воинами, чтобы они служили ему и могли отомстить своим убийцам.
А кристаллы были нужны Теням затем, чтобы объединив их, суметь отобрать силу самого Хаоса, поделив ее между собой и поработить весь Космос! Зная об этом и желая помешать им, Хаос и сам решил вступить в эту войну, выступив на стороне сейлоров, ведь у них теперь был общий враг. Но так как сенши никогда не приняли бы Хаос, он решил предстать им в виде человека и скрывать о том, кто он такой.

С кем будет Усаги? Простят ли сенши старсов? Не перейдет ли Темная Луна на сторону Металлии? Станут ли новые воины врагами Сейлор Мун или союзниками? Получат ли Тени пяти кристаллов? Все в ваших руках!